Medicininių atliekų smulkintuvų specifikacijos pirmiausia priklauso nuo jų apdorojimo pajėgumų ir taikomų scenarijų. Maži smulkintuvai paprastai suprojektuoti su maždaug 50–200 kg kasdieniu apdorojimu, tinkami bendruomenės ligoninėms, klinikoms ir laboratorijoms; vidutinio ir didelio gabarito įranga gali apdoroti nuo 500 kg iki kelių tonų, tinka didelėms gydymo įstaigoms ar centralizuotiems medicininių atliekų apdorojimo centrams. Dėl skirtingų apdorojimo pajėgumų atitinkamai skirsis įrangos dydis, svoris ir galia.
Kalbant apie konstrukcines specifikacijas, pagrindiniai rodikliai taip pat yra smulkintuvo šlifavimo kamera ir ašmenų konstrukcija. Ašmenų skaičius, ašmenų tipas, sukimosi greitis ir išėjimo dalelių dydis tiesiogiai veikia smulkinimo efektą. Aukštos specifikacijos įrangai paprastai naudojama kelių ašmenų, didelio greičio sukimosi konstrukcija, galinti apdoroti įvairias medicinines atliekas, tokias kaip švirkštai, infuzijos vamzdeliai ir vaistų buteliai, tuo pačiu užtikrinant vienodą smulkinimą vėlesniam sterilizavimui. Elektros ir pagalbinių sistemų specifikacijos taip pat yra svarbūs parametrai. Įrangos galią, įtampą, perdavimo sistemos tipą ir valdymo sistemos automatizavimo laipsnį reikia nustatyti atsižvelgiant į veikimo aplinką ir apkrovos reikalavimus. Aukštos specifikacijos įranga paprastai aprūpinta saugos įtaisais, apsauga nuo perkrovos ir automatinio išjungimo funkcijomis, užtikrinančiomis operatoriaus saugą ir gerinant įrangos stabilumą ir patikimumą.